La storia Gaya Mater Studiorum nasce nel 1989, quando il collettivo universitario gay e lesbico "La Pantera Rosa", che organizzava iniziative nella sede delle aule di via Guerrazzi, 20 (dove all'epoca si svolgevano le lezioni del DAMS), si divide in due gruppi: uno femminile, "Le Signore della Porta Accanto", e l'altro maschile, "Gaya Mater Studiorum" (ufficialmente nato il 20/11/89), il cui nome ricalca il sottotitolo latino dell'università bolognese, "Alma Mater Studiorum".
Con il riflusso seguito al movimento della Pantera si perdono ben presto le tracce di entrambi tanto che due anni dopo ne rimangono solamente qualche adesivo o pubblicità su Contatto, rivista periodica pubblicata dalla Segreteria nazionale dell'allora Arcigay-Arcilesbica.